La Cámara Nacional del Autotransporte de Carga se creó en el 8 de junio de 1989 en una Asamblea General Extraordinaria y sus agremiados acuerdan  concertar con las autoridades correspondientes el Programa para la Modernización del Autotransporte de Carga. Canacar se constituyó como institución pública y  autónoma, con personalidad jurídica y patrimonio propio, especializada en la prestación de servicios a los autotransportistas de carga. La creación del organismo fue la respuesta de los transportistas de carga para enfrentar organizadamente la política de desregulación del servicio y evitar la dispersión y atomización del sector.

Con la desregulación despareció la obligatoriedad de pertenecer a las centrales de carga; desapareció también la estructura de servicios regulares por ruta y el especializado por producto; la obligatoriedad de las tarifas, para que a partir de entonces éstas se fijen libremente por la oferta y la demanda; se abrogaron los Comités Estatales o Regionales y los Comités Técnicos de Autotransporte Federal que desde 1977 concedían los permisos para prestar el servicio y se regularizaron los que trabajaban sin concesiones ni  permisos, asi, los transportistas pasaron de ser concesionarios a permisionarios.